Ressources atelier
- Environnement sur Google Colab
- Aller à l'URL https://colab.research.google.com/
- Se connecter avec son compte Google
- Aller dans l'onglet GitHub
- Coller l'URL du notebook Github
- Sélectionner le notebook dans la liste
- L'environnement est ensuite disponible (page d'accueil du notebook)
- Environnement local (Python ou Anaconda)
- Cloner ou télécharger le répo : https://github.com/Thibault-Pelletier/MonaiWorkshop.git
- Télécharger les données BRATS 2015 depuis l'un des liens suivants :
- Créer un environnement virtuel Python 3.8 (python ou anaconda)
- Activer l'environnement virtuel Python
- Lancer la commande pip install -r requirements.txt
- Tester l'environnement virtuel en lançant les deux commandes python suivantes :
- from monai.config import print_config
- print_config()
- (optionnel) Télécharger Slicer 4.11 à l'adresse suivante :
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